遭重创，一时再难以南下，但皇太极却采取了范文程的计策，对关内的流寇大加资助，武器与资金，让明朝国中，原来被遏止下去的流寇，重新兴盛了起来。

于是，李自成从商洛山重新兴盛，先后在山陕等地大肆荼毒，现在竟已重新流窜的河南等地，开始再度入寇豫西等地。

而另一个巨寇张献忠，此人曾被长期压制在湖广郧阳之地，现在，业已趁着官军剿匪的松懈，重新发展壮在，又重新在湖广西部荼毒炽盛，现在的他，已裹挟了兵力十余万，正逆江而上，直取东川。

贼军势力若破竹，先后攻破了巫山，白帝，瞿塘等地，遂即全军围攻夔州府。

此前，曾有罗汝才部，在张献忠之前，也来攻打夔州，却被当地的守将秦良玉所击败。

秦良玉，忠州人。胆智过人，擅长骑射，又擅长作文章，姿态风度娴静文雅。

行军治兵，号令严明，所领军队号称

“白杆兵”，远近闻名。天启元年，后金包围重镇沈阳，秦良玉于是亲率三千前往直抵榆关，其部白杆兵，由其侄秦邦屏率领，在浑河血战中，杀敌致果，斩首数千，为明军在辽东的系列守卫战中，最为耀眼的一道亮色。

明廷遂下诏，给秦良玉加二品官员服饰，并封秦良玉为诰命夫人，封秦良玉儿子马祥麟为指挥使。

后来兵部尚书张鹤鸣也进言，说浑河血战能斩获敌人首级数千，实际上是石柱、酉阳两地土司的功劳，尤以秦良玉的白标兵为功大，建议朱由校厚待秦良玉家的家人。

天启皇帝朱由校于是下令赠牺牲的秦邦屏为都督佥事，子孙世袭，并且与陈策等人一同立祠祭祀，秦邦屏之弟秦民屏，则官进都司佥书。

天启二年，奢崇明包围成都，四川巡抚朱燮元传令秦良玉前去征讨。当时各地的土司都贪图贼寇的贿赂，按兵不动，只有秦良玉击鼓西征。

秦良玉率军攻取新都，长驱直奔成都，将奢崇明击败，解了成都之围。

奢崇明败走后，秦良玉率领秦民屏等攻克二郎关、佛图关，收复重庆。

朝廷于是授命秦良玉为都督佥事、充总兵官，并加封为夫人，授马祥麟为宣慰使，秦民屏为副总兵，秦翼明、秦拱明为参将。

授官后，秦良玉又收复红崖墩、观音寺、青山墩等贼军重要据点，奢崇明兵败自杀，秦良玉彻底平定奢崇明四川之乱。

朝廷因功多次赏赐秦良玉金币。崇祯三年，清军大举进攻，永平四城失守，皇太极进围京都。

秦良玉率自家子侄秦翼明，奉诏勤王，并在朝廷财政困难的情况下，拿出家中的资产充作军饷。

崇祯皇帝朱由检十分感动，特意下诏表扬，并于平台召见秦良玉，赏赐秦良玉钱币牲畜酒水等，并赋诗四首表彰秦良玉的功劳。

自此之后，忠于明廷的秦良玉，深受崇祯皇帝的信赖，她手下的白杆兵，名扬天下，成为明末之时，朝廷相当倚重的一支劲旅。

由于流贼重新起势，鉴于东川形势危急，朝廷专门下令，让秦良玉率领其部白杆兵一万人，从川南一带，东赴夔州府，守住这个最为重要的入川隘口。

本来，为了何证夔州有足够的兵力可用，杨嗣昌还专门下令，让湖广总兵左良玉，也出兵二人协助，不料，此时的左良玉，已是完全的猖狂跋扈，对杨嗣昌的命令，根本就不听取，杨嗣昌先后派了九次使者，去给左良玉传令，却皆被左良玉以各种理由推脱。

故现在，这夔州城中，仅有秦良玉这一部一万人的兵马守卫城池，再无其他的明朝援军。

罗汝才部率军进入东川后，秦良玉率军前往，罗汝才不战而走，秦良玉追至马家寨，大破罗汝才，斩首数千级，秦良玉又率军追击，先后在留马垭、谭家坪北山