勇，不管跟着谁，都尽心尽力，很有职业军人的风范。跟随名将来护儿，获赞“此人勇悍，加有志节”。到了张须陀手下，勇武征战，仅率千人就敢奇袭十万敌军大营！张须陀在荥阳大战瓦岗李密，不幸战死，秦琼投奔裴仁基，没想到裴仁基又投降了李密，秦琼被“捆绑销售”给了李密。

李密与宇文化及的大军激战于黎阳童山，李密为流矢所伤，堕马昏死过去，身边护卫全跑了，唯有秦琼孤身誓死捍卫，李密才获救。而后秦琼又收拾兵力，与宇文化及大军力战，并将其击退。只是此后李密开始骄傲自负，瓦岗军团上下离心离德，逐渐衰落，最终被王世充击溃。

没想到，李密竟然不管兵败被俘的秦琼等人，跑去长安投靠了李渊，秦琼无奈，只得投靠了王世充。王世充大喜，任命秦琼为“龙骧大将军”，但秦琼却对王世充的为人颇为不齿，认为此人阴险狡诈，心胸狭隘，“非人主也”。几个月后，秦琼、程知节等人于九曲对阵之时，在两军阵前投奔了李唐。良禽择木而栖，走也走得光明正大！

投奔李渊，秦琼被分配给了李世民，也是他最后一位老板。秦琼表现出了山东大汉一惯的忠勇，跟随李世民先后击败王世充、窦建德、刘黑闼等多路义军，为唐王朝的创建立下了汗马功劳。